Cami, II. Beyazıt döneminde Şeyhülislam Efdalzade Hamidüddin Efendi tarafından medrese olarak yaptırılmıştır. Daha sonra avlunun bir kenarında yer alan odalardan biri cami haline dönüştürülmüştür. Yılmaz Yapı Ltd. Şti. sponsorluğunda 2016 yılında restorasyonu gerçekleştirilmiştir.
